• Unidade/Instituição: Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo (ICB-USP)
• Pesquisador responsável: Robson Francisco de Souza
• Inscreva-se até: 10/08/2025

O bolsista será responsável pela otimização e gerenciamento de computadores de alta performance (HPC), instalação e execução de softwares e rotinas de análise para genômica, transcriptômica, genômica comparativa, biologia estrutural e áreas correlacionadas. Deverá ser capaz de gerenciar e implementar interfaces web para as rotinas de análise na plataforma Galaxy usando o balanceamento de tarefas com o software SLURM nos servidores de HPC do projeto. Atuará no suporte dos membros do CEPID B3, um Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão apoiado pela FAPESP com sede no ICB-USP.

Requisitos:

• Experiência mínima de 2 anos (após a graduação) em projetos de bioinformática envolvendo montagem e gerenciamento de pipelines de bioinformática com aplicações em genômica, transcriptômica ou biologia estrutural;
• Conhecimentos em administração de sistemas Unix/Linux;
• Experiência no desenvolvimento de scripts e programação orientada a objetos.

Diferencial:

• Domínio de linguagens de programação Python e R, Perl;
• Experiência no uso e desenvolvimento de pipelines nas plataformas Snakemake e NextFlow;
• Experiência no desenvolvimento de algoritmos de análise em bioinformática;
• Competência em métodos análises de dados e proficiência no uso de estatística;
• Experiência como programador no desenvolvimento e integração de aplicativos web.

Mais informações sobre requisitos e benefícios da Bolsa FAPESP de Treinamento Técnico nível quatro “a” (TT-IV-A) 

Em caso de dúvidas, entre em contato via e-mail: cepid-b3@iq.usp.br

Para se candidatar, preencha aqui o formulário