Laboratório de Biologia Molecular de Coccídias
Laboratory of Molecular Biology of Coccidia
Linha de pesquisa: Biologia molecular de coccídeos aviários; Bioinformática aplicada ao estudo de patógenos
Research interests: Molecular biology of avian coccids; Bioinformatics applied to the study of pathogens
Resumo: A pesquisa multidisciplinar está dividida em duas linhas complementares. A primeira aborda a biologia molecular e genômica de protozoários parasitas do gênero Eimeria de galinha doméstica. Entre os trabalhos desenvolvidos estão ensaios diagnósticos usando diferentes marcadores moleculares e a caracterização de genomas extracromossômicos dos parasitas. O grupo também caracterizou o transcriptoma do parasita amostrando várias espécies e estágios de desenvolvimento. Na área de Bioinformática, o grupo tem desenvolvido ferramentas para análises de sequências, incluindo o EGene, uma plataforma de construção de pipelines de processamento e anotação
automática de sequências. Todos os aplicativos desenvolvidos são open source e têm sido utilizados pelo grupo nos projetos de sequenciamento, assim como pela comunidade científica em diferentes projetos.
Abstract: The multidisciplinary research is divided in two complementary lines. First, the group conducts a study on the molecular biology and genomics of protozoan parasites of the genus Eimeria of domestic fowl. Amongst their achievements, they developed different types of molecular markers for diagnostic purposes, and characterized parasite extrachromosomal genomes. They also characterized the
parasite transcriptome assessing different species and developmental stages. In the field of Bioinformatics, the group has developed several tools for sequence analysis, including EGene, a pipeline construction platform for automatic sequence processing and annotation. All bioinformatics tools are open source and have been used by the group in the sequencing projects and also by the scientific community in several different projects.
+ 55 (11) 3091-7274
ICB II, Departamento de Parasitologia
Participações
